事业编辞职后果会除名处理，并且不可以再考公务员、事业单位，且未经批准擅自离职的，均属无故旷工行为可以除名，如果双方对解除聘用合同另有约定按约定违反约定而离职的后果是以后会被限制报考公务员或者事业单位，因此还是要考虑清楚。

会除名处理，并且不可以再考公务员、事业单位。职工自动离职给单位造成了损失，单位要求职工赔偿或交付违约金而发生的争议，称为自动离职争议。

因此未经批准，擅自离职的，或停薪留职期满后1个月以内，本人既未要求回原单位工作，又未办理辞职手续的，均属无故旷工行为可以除名。

如果双方对解除聘用合同另有约定，按约定，违反约定而离职的，后果是以后会被限制报考公务员或者事业单位，因此，还是要考虑清楚。

《事业单位人事管理条例》第15条 事业单位工作人员提前30日书面通知事业单位，可以解除聘用合同。但是，双方对解除聘用合同另有约定的除外。