公务员体检妇科不合格标准主要涉及对性病、恶性肿瘤等重点疾病的检查。在体检过程中，对于已婚女性，会检查外阴、阴道、宫颈、宫体、附件及阴道分泌物性状、颜色、气味等;对于未婚女性，则会检查外阴发育情况，并进行肛诊检查，以了解阴道、宫颈及盆腔情况。

妊娠期的女性原则上不做妇科检查，但应在体检表中注明原由，并在妊娠结束后补做上述检查，以完成体检结论。此外，还会询问月经初潮年龄、周期、出血量、持续时间、末次月经时间，以及有无痛经、白带性状、外阴瘙痒、下腹疼痛、排尿异常等症状，并重点询问婚育史、既往手术史、肿瘤病史等，以发现异常情况。