人事代理与事业编制退休的主要区别如下：

主办单位不同。人事代理通常由政府人事部门所属的人才服务机构办理，而事业编制退休是由国家事业单位办理。

性质不同。人事代理是一种市场化、专业化和社会化的人事管理方式，而事业编制退休是计划经济时期延续至今的退休制度。

管理体制不同。人事代理采用企业化管理，而事业编制退休采用行政事业单位管理。

用工形式和合同性质不同。人事代理员工与用人单位签订劳动合同，但不一定建立事业编制关系，可能是劳务派遣或合同工;事业编制员工与事业单位签订劳动合同，成为单位正式编制内员工。

工作性质不同。人事代理通常是短期、临时性或特定项目性的工作;事业编制工作相对稳定，通常是长期、稳定的岗位。

社保和福利待遇不同。人事代理通常享受基本社会保险，但福利待遇可能不如事业编制员工;事业编制员工一般可以享受更丰厚社会保险和福利待遇，如养老金、医疗保险、住房公积金等。

退休和养老不同。人事代理一般不享受单位提供的养老金待遇，退休后依赖个人缴纳的社保;事业编制员工在达到法定退休年龄后，可以领取养老金，享受相对稳定的退休生活。

这些差异反映了不同用工形式在员工待遇、权益以及退休方面的不同安排。