舅舅有案底一般不会影响外甥考公务员。

1、直系血亲中或对本人有较大影响的旁系血亲中有被判处死刑或者正在服刑的属于不合格的情形，是不能录取的。

2、录用考核的内容为德、能、勤、绩四个方面。

3、我国不实行连坐制度，因此可以考公务员。

法律依据：

《公务员法》第五条

公务员的管理，坚持公开、平等、竞争、择优的原则，依照法定的权限、条件、标准和程序进行