关于新疆地区历代的管辖机构，下列说法错误是:

A.西域都护府设立于西汉

B.安西都护府最终被吐蕃攻陷

C.元朝设立宣政院管辖新疆地区

D.伊犁将军为清朝新疆地区最高军政长官

【正确答案】：C

【解析】第一步，本题考查历史知识并选错误项。

第二步，宣政院，初名总制院，是中国元朝时期设立的一个直属中央政府管辖的国家机构，负责掌管全国佛教事宜并统辖吐蕃(今西藏)地区的军政事务。而不是新疆地区。C项错误。

因此，选择C选项。