公务员档案审查不通过的原因主要包括档案丢失或材料不全、档案在自己手里、档案里有处分或案底、年龄问题、党员(党龄)相关问题、工作经历(工龄)问题、学历问题、处分问题、违法犯罪记录及不当言论问题、亲属违法犯罪记录问题、被举报等。

档案问题：档案丢失或材料不全，尤其是缺少毕业生登记表、成绩单、学年考评表等重要材料;档案在自己手里，尤其是未存放在具有档案管理权限的地方;档案里有处分或案底，如刑事拘留等严重违法记录;档案信息涂改或填错，导致与事实不符。

年龄问题：年龄记错或改小/大导致推算上学时间不合理;阴阳历颠倒与记错记混交叉;人为改大年龄导致推算上学时间不合理。

党员(党龄)相关问题：违规异地入党、异地转正;不满18岁入党。

工作经历(工龄)问题：隐瞒工作经历、错填漏填工作经历、工作证明材料丢失(劳动合同和离职证明等);社保挂靠代缴问题。

学历问题：学历断层(不连贯、缺少前置学历)、学历重叠问题、高考移民、学习经历填写错误、违规借读。

处分问题：在校期间受到处分、在部队受处分。

违法犯罪记录及不当言论问题：有违法犯罪记录、不当言论的涉案记录。

亲属违法犯罪记录问题：直系亲属或旁系亲属的违法犯罪记录。

被举报：私德问题，如第三者插足、考警察在KTV点有偿陪侍等被举报。

政审环节重点审查档案内容的真实性、完整性和合法性，任何与事实不符或违反法律法规的记录都可能导致政审不通过。因此，考生需确保个人档案的完整性和真实性，避免任何可能影响政审通过的问题。